Skupština je najviši organ upravljanja organizacije a čine je svi aktivni članovi. Aktivnost članova u sprovođenju projekata i akcija vrednuje se na osnovu Pravilnika o valorizaciji rada, na osnovu kojeg se postiže i status aktivnog člana, odnosno člana Skupštine BPSA.

Iz redova aktivnih članova bira se pet članova u Izvršni odbor koji međusobom biraju Predsednika i Sekretara. Na čelu Izvršnog odbora, koji predstavlja izvršni organ Skupštine, nalazi se Predsednik kome u izvršavanju dužnosti pomaže Sekretar.

Primarna zaduženja Predsednika BPSA su predsedavanje Skupštinom i Izvršnim odborom, predstavljanje asocijacije u javnosti, vođenje i koordinacija najznačajnijih programa, pronalaženje izvora finansiranja, projektovanje marketing strategije, razvijanje aktivnosti i širenje članstva. Sekretar je zadužen za unutrašnju organizaciju rada i vođenje arhiva. Izvršni odbor BPSA imenuje koordinatore projekata u skladu sa potrebama pa tako u okviru BPSA deluju sledeći koordinatori: